Благодаря сложным и тесно переплетенным отношениям лес является единым целым, и почти никогда нельзя с уверенностью сказать, прерывание каких отношений может привести за собой гибель всего целого. О том, что уже сегодня мы уничтожаем многие важные связи в лесу, говорит факт, что 31% видов животных и растений под угрозой вымирания в Эстонии связаны именно с лесом.
Ценность и сила леса зависят от разнообразия в нем. Лес предоставляет места обитания разным видам, в том числе редким. Интенсивное лесное хозяйство, характеризующее начало этого века, оказывает сильное давление на большую часть флоры и фауны Эстонии. В самом трудном положении оказываются именно виды, обитающие в старых, созревших для рубки, лесах. По оценкам ученых, для сохранения этих видов в Эстонии следует оставить под естественное развитие по крайней мере 10% площади всех лесов. Основной деятельностью Эстонского Фонда Природы по вопросам леса является внедрение принципов устойчивого (экономически, социально и экологически уравновешенного) лесного хозяйства в эстонскую лесную политику, а также исследование и охрана лесов.